Самый легкий способ удалить через админку ( www.site.com/admin/users/recent) . Это удалит и юзера и его контент автоматически.

Можно удалить руками через базу( ow_base_user), но в этом случае придется пройтись еще почти по всем другим таблицам что бы удалить контент связанный с этим юзером. 

Как третий вариант если контент не нужен, переустновите весь софт и с бэкапа перетащите на чистую установку то что нужно обратно.

Удалить 6000 пользователь из админки руками будет не очень удобно. 3-ий вариант я конечно имею под рукой, но надеялся что есть более прямой способ. Жаль что нет.

Теоретически, можно увеличить количество выводимых юзеров в админке>>browse users.

Сейчас выводится 20 юзеров. 

В user_list.php ( ow_system_plugins/admin/components) увеличить число $onPage = 20;  до нужного/удобного количества. К примеру 500. А затем обычным способом через select all удалить юзеров. 

Должно немного облегчить работу.